Деревянная однопрестольная церковь была заложена в ноябре 2015 года. Ранее в Останкине не было собственного храма, и верующие посещали богослужения в храме в честь святителя Николая Чудотворца в соседнем селе Заскочиха.
Храм в Останкине построен в рамках реализуемой в Русской Православной Церкви с 2012 года программы обеспечения каждого населенного пункта местами для молитвы.
15 мая 2018 года митрополит Георгий совершил чин Великого освящения храма-часовни.
